Гуррагча родился 5 декабря 1947 года в стойбище скотоводов у горы Ховынхан. В семье было 18 детей, но из-за суровых условий выжили только десять. В пять лет Гуррагча сел на коня, а в семь его отдали в интернат учиться на врача — самую престижную в степи профессию. Однако после школы он поступил в сельскохозяйственный институт Улан-Батора, откуда его призвали служить в армию — в части ПВО. Потом он был направлен учиться в школу младших авиационных специалистов в СССР, а в июле 1972 года Гуррагча поступил в Военно-воздушную инженерную академию им. Н.Е. Жуковского в Москве.
Вскоре было заключено соглашение о полетах в космос представителей стран социалистического лагеря, и в марте 1978 года Жугдэрдэмидийна и еще одного монгольского летчика Майдаржавына Ганзорига отправили на подготовку в Звездный городок. А ровно через три года — 22 марта 1981 года — Гуррагча вместе с Владимиром Джанибековым полетел в космос на борту корабля «Союз-39». Таким образом, Монголия стала десятой страной мира, чей гражданин совершил космический полет.
